Detalles de la búsqueda
1.
A Workflow for Improved Analysis of Cross-Linking Mass Spectrometry Data Integrating Parallel Accumulation-Serial Fragmentation with MeroX and Skyline.
Anal Chem
; 96(19): 7373-7379, 2024 May 14.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38696819
2.
MSstats Version 4.0: Statistical Analyses of Quantitative Mass Spectrometry-Based Proteomic Experiments with Chromatography-Based Quantification at Scale.
J Proteome Res
; 22(5): 1466-1482, 2023 05 05.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37018319
3.
Evaluating the Performance of the Astral Mass Analyzer for Quantitative Proteomics Using Data-Independent Acquisition.
J Proteome Res
; 22(10): 3290-3300, 2023 10 06.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37683181
4.
Skyline Batch: An Intuitive User Interface for Batch Processing with Skyline.
J Proteome Res
; 21(1): 289-294, 2022 01 07.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34919405
5.
Development and Application of Multidimensional Lipid Libraries to Investigate Lipidomic Dysregulation Related to Smoke Inhalation Injury Severity.
J Proteome Res
; 21(1): 232-242, 2022 01 07.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34874736
6.
Selection of Features with Consistent Profiles Improves Relative Protein Quantification in Mass Spectrometry Experiments.
Mol Cell Proteomics
; 19(6): 944-959, 2020 06.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-32234965
7.
Audit logs to enforce document integrity in Skyline and Panorama.
Bioinformatics
; 36(15): 4366-4368, 2020 08 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-32467974
8.
Skyline for Small Molecules: A Unifying Software Package for Quantitative Metabolomics.
J Proteome Res
; 19(4): 1447-1458, 2020 04 03.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-31984744
9.
Statistical control of peptide and protein error rates in large-scale targeted data-independent acquisition analyses.
Nat Methods
; 14(9): 921-927, 2017 Sep.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-28825704
10.
Standardization of PGC-LC-MS-based glycomics for sample specific glycotyping.
Analyst
; 144(11): 3601-3612, 2019 Jun 07.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-31065629
11.
MS1 Peptide Ion Intensity Chromatograms in MS2 (SWATH) Data Independent Acquisitions. Improving Post Acquisition Analysis of Proteomic Experiments.
Mol Cell Proteomics
; 14(9): 2405-19, 2015 Sep.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-25987414
12.
Multiplexed MS/MS for improved data-independent acquisition.
Nat Methods
; 10(8): 744-6, 2013 Aug.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-23793237
13.
Platform-independent and label-free quantitation of proteomic data using MS1 extracted ion chromatograms in skyline: application to protein acetylation and phosphorylation.
Mol Cell Proteomics
; 11(5): 202-14, 2012 May.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-22454539
14.
A framework for quality control in quantitative proteomics.
bioRxiv
; 2024 Apr 25.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38645098
15.
Targeted proteomics data interpretation with DeepMRM.
Cell Rep Methods
; 3(7): 100521, 2023 07 24.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37533638
16.
Evaluating the Performance of the Astral Mass Analyzer for Quantitative Proteomics Using Data Independent Acquisition.
bioRxiv
; 2023 Aug 07.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37398334
17.
Utilizing Skyline to analyze lipidomics data containing liquid chromatography, ion mobility spectrometry and mass spectrometry dimensions.
Nat Protoc
; 17(11): 2415-2430, 2022 11.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35831612
18.
Cullin-independent recognition of HHARI substrates by a dynamic RBR catalytic domain.
Structure
; 30(9): 1269-1284.e6, 2022 09 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35716664
19.
Improving Precursor Selectivity in Data-Independent Acquisition Using Overlapping Windows.
J Am Soc Mass Spectrom
; 30(4): 669-684, 2019 Apr.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-30671891
20.
Using Skyline to Analyze Data-Containing Liquid Chromatography, Ion Mobility Spectrometry, and Mass Spectrometry Dimensions.
J Am Soc Mass Spectrom
; 29(11): 2182-2188, 2018 Nov.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-30047074